L'Università degli Studi di Milano-Bicocca è nata nel 1998 per rispondere alla esigenza di decongestionare l'Università Statale di Milano, ormai giunta a essere classificata come mega-ateneo a causa dell'elevato numero di studenti iscritti. Già all'inizio degli anni '90, però, si era cominciato a decentrare alcune attività didattiche e di ricerca nel polo tecnologico della Bicocca, una vasta area ex-industriale destinata a riqualificarsi mediante importanti insediamenti produttivi, culturali, di ricerca, e residenziali. Nascevano così a partire dal 1992 nuovi corsi di laurea scientifici caratterizzati da una forte natura interdisciplinare, Scienze Ambientali (1992), Scienza dei Materiali (1994), e Biotecnologie (1995). Attorno a questo polo si sviluppava poi l'intera Facoltà di Scienze nonchè le altre Facoltà dell'Ateneo, che ha assunto un ruolo giuridico proprio il 1 Novembre 1998. Oggi la Facoltà ha una struttura consolidata, circa 5000 studenti iscritti e circa 250 docenti. Oltre 10.000 metri quadrati sono destinati ad attività di ricerca, mentre ampi spazi sia in termini di aule, che di laboratori didattici, che di spazi studio sono destinati agli studenti frequentanti.

L'obbiettivo didattico di tutti i corsi di laurea della Facoltà è quello di fornire agli studenti con interesse per discipline scientifiche gli strumenti per adattarsi alla costante e rapida evoluzione di metodi, tecnologie e processi che contraddistingue le società fortemente industrializzate. Questa adattabilità e flessibilità costituisce uno degli elementi più importanti per potersi inserire con successo nel mondo del lavoro.

Presso la Facoltà sono attivate le lauree triennali in Biotecnologie, Fisica, Informatica, Matematica, Ottica e Optometria, Scienza dei Materiali, Scienze Biologiche, Scienze e Tecnologie Chimiche, Scienze e Tecnologie Geologiche, Scienze e Tecnologie Orafe, Scienze e Tecnologie per l'Ambiente. Da queste lauree triennali è possibile accedere alle Lauree Magistrali in Astrofisica e Fisica dello Spazio, Biologia, Biotecnologie Industriali, Fisica, Informatica, Matematica, Scienza dei Materiali, Scienze e Tecnologie Chimiche, Scienze e Tecnologie Geologiche, Scienze e Tecnologie per l'Ambiente e per il Territorio.

La formazione specialistica è completata dai Dottorati di Ricerca in Biotecnologie Industriali, Fisica e Astronomia, Informatica, Matematica Pura e Applicata, Nanostrutture e Nanotecnologie, Scienza dei Materiali, Scienze Ambientali, Scienze Chimiche, Scienze Geologiche e Geotecnologiche per l'Ambiente e il Territorio - raggruppati e organizzati nella Scuola di Dottorato di Facoltà. Per i laureati in discipline Biologiche e Biotecnologiche, e' possibile anche l'accesso alla Scuola di Dottorato in Medicina Traslazionale e Molecolare. Sono inoltre presenti numerosi corsi di Master universitario.